Estado: auditoría estructural y subpilotos estrictos en curso; resultados descriptivos reproducibles, sin conclusiones de rendimiento, afinidad o actividad biológica.
Proyecto independiente para construir un conjunto curado de complejos proteína–ligando de acceso público y auditar su preparación para campañas de redocking reproducibles. No utiliza entradas, estructuras ni resultados del proyecto doctoral.
¿Qué condiciones documentables de procedencia, estructura, composición y preparación permiten decidir si un complejo público es apto para un experimento de redocking de referencia?
- un conjunto de casos y un manifiesto versionado;
- scripts que descargan, verifican y registran cada entrada;
- informes por caso, incluidos motivos explícitos de exclusión;
- figuras y tablas generadas desde los manifiestos;
- depósito reproducible (repositorio + Zenodo) antes de cualquier manuscrito.
El objetivo no es afirmar que una herramienta es superior ni extrapolar eficacia farmacológica. Los resultados son descriptivos y reproducibles, limitados a los casos que cumplan el protocolo. Las preparaciones rechazadas bajo una política congelada también se conservan como resultados.
protocol/ criterios, decisiones y registro de cambios
data/ manifiestos CSV/JSON; nunca resultados sin procedencia
scripts/ recuperación, auditoría y generación de informes
reports/ salidas derivadas y trazables
Las estructuras y sus metadatos se recuperarán exclusivamente desde RCSB PDB/wwPDB mediante identificadores y URLs registradas. Cada caso conservará checksum, fecha de recuperación, formato, método experimental y referencia al informe de validación.
No se incorporará a un resultado un número, pose, clasificación o figura que no pueda regenerarse desde los archivos y scripts versionados. Las exclusiones son resultados válidos y se conservarán.
Consulte el protocolo inicial antes de añadir casos. La expansión controlada se describe en EXPANSION-PLAN-v0.1.md; los resultados actuales del subpiloto están en SUBPILOT-RESULTS-v0.1.md.